Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
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