Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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