Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6aQ78XR0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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