Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms