Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc88cQ6VGS5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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