Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim37Q6PCX9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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