Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt77Q6IFZ6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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