Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc3c1Q6DFV6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms