Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms