Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprdQ64487 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms