Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim24Q64127 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms