Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Taf6Q62311 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms