Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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