Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm27Q5SFM8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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