Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc3lQ4KL14 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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