Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smim26Q3V460 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms