Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9Q3V038 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ttc9Q3V038 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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