Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnpc3Q3UZ01 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms