Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms