Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms