Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms