Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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