Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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