Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms