Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms