Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms