Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms