Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gtf3c3Q3TMP1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf3c3Q3TMP1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf3c3Q3TMP1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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