Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms