Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf541Q0GGX2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms