Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp2Q08652 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms