Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms