Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms