Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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