Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms