Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sec23aQ01405 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sec23aQ01405 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sec23aQ01405 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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