Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tarbp2P97473 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms