Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms