Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms