Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arf1P84078 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Arf1P84078 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms