Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms