Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp25P57080 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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