Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Atp5eP56382 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp5eP56382 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms