Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms