Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms