Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VdrP48281 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VdrP48281 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms