Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ItgavP43406 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms