Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Apoc3P33622 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Apoc3P33622 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms