Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc5P32043 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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