Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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